Загрузитесь с исправленного аварийного диска. Если все пойдет как надо, то вы окажетесь в меню программы установки Debian. Единственное отличие будет в том, что вы будете работать с ZIP диском. Продолжайте установку, как если бы ставили систему на жесткий диск, только подключите в качстве корневой файловой системы /dev/sda1, а в качестве раздела подкачки - /dev/sda2.
Есть еще одно отклонение от стандартного процесса установки - не устанавливайте и/или не настраивайте подгружаемые модули. Они будут установлены позже (пункт 7.3.2).